Les prospections menées en septembre 2001 ont permis d'identifier plusieurs menaces en fonction du milieu où se développe le Sélin de Brotero : abandon ou précocité de la fauche (prairies mésophiles) et dans une moindre mesure aujourd'hui, désherbage,
Sur les banquettes herbeuses des chemins de halage et des bords de route, les populations de Sélin de Brotero sont assez clairsemées dès lors que les stations sont régulièrement fauchées en été (juin - juillet) voire avant. On a observé dans plusieurs cas, que les individus de Selinum n'étaient visibles que dans des endroits n'ayant toujours pas été fauchés en septembre : ils pouvaient alors y boucler leur cycle végétal, en produisant des graines. En outre, dans les endroits fauchés, le produit de fauche est rarement exporté et son accumulation sur place conduit souvent au développement de plantes nitrophiles telles que l'Ortie dioïque. Dans ces secteurs, le Sélin de Brotero semble très menacé par la concurrence végétale (Guégon - Pont du Sedon - Languidic - Trébihan). Cette concurrence constitue aussi une menace forte dans certaines stations de bords de chemins qui ne semblent pas avoir été fauchés depuis plusieurs années (route de Guégon, Penhouët en Pleugriffet, Montertelot).