À l'exception, certaines années, de quelques couples isolés, l'ensemble des Sternes de Dougall se reproduit sur des îlots en réserve, et principalement celles de l'association Bretagne Vivante. Les actions conduites annuellement sur ces réserves contribuent à maintenir les potentialités d'accueil pour l'espèce et notamment à éviter les dérangements humains tout en informant le grand public. Mais le problème de la prédation par les visons d'Amérique devient majeur. Il ne pourra être résolu que par des campagnes de piégeage intensif, à la fois sur les îlots et sur le littoral proche.
Si les mesures de protection prises sur les colonies de reproduction en Europe ont prouvé leur efficacité (gestion de la végétation, contrôle des prédateurs, limitation des dérangements humains, etc.), l'attention devrait aussi être portée sur les zones d'hivernage. En effet, une des principales causes du déclin de la Sterne de Dougall semble être la destruction de nombreux oiseaux, pratiquée surtout par les enfants à des fins alimentaires ou ludiques, sur les quartiers d'hivernage africains, et notamment sur les côtes du Sénégal et du Ghana. C'est pourquoi des campagnes d'information et de sensibilisation des habitants dans ces pays ont été lancées depuis une quinzaine d'années, opérations menées conjointement par les gouvernements concernés et par des associations européennes de protection de l'environnement. Cet exemple montre bien l'importance de la coopération internationale en matière de protection de la nature.
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