Le Vison d’Europe est protégé en France par une réglementation nationale et européenne. Il bénéficie d’un plan de sauvegarde national qui s’exerce en priorité dans le Sud-Ouest où subsiste la seule population française.
Le Vison d’Europe est l’une des espèces les plus menacées d’extinction en Europe et il est considéré comme en danger en France d’après l’Union internationale pour la conservation de la nature. L’espèce est protégée par la directive Habitats-Faune-Flore (annexes II et IV), la convention de Berne (annexe II) mais aussi par la réglementation française.
En 1999, le Ministère de l’environnement a lancé un premier plan quinquennal de restauration du Vison d’Europe animé par la Mission Vison d’Europe et qui s’applique à une zone prioritaire. Celle-ci comprend l’aire actuelle de répartition de l’espèce (sud-ouest de la France) et sa frange périphérique afin de favoriser sa recolonisation.