Présentation :Le réseau de mesure de la qualité des estuaires bretons, dont la Diren est maître d’ouvrage, fonctionne depuis début 1999. Les cellules qualité des eaux littorales (CQEL) des quatre DDE de Bretagne réalisent des prélèvements à l’aide de 200 stations de mesures réparties sur 28 estuaires bretons :
-  1 estuaire en Ille-et-Vilaine ;
-  4 estuaires dans les Côtes d’Armor ;
-  13 estuaires dans le Finistère;
-  10 estuaires dans le Morbihan. Trois critères sont mesurés : l’oxygène, l’ammoniaque et la bactériologie.

 Qualité des estuaires bretons de 2002 à 2004
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 Qualité des estuaires bretons de 2004 à 2006
Pour la période 2004-2006, l’oxygénation et le bilan ammoniaque sont tous deux globalement bons sur l’ensemble des estuaires bretons. Ces deux paramètres favorables permettent des conditions propices pour le passage des espèces migratrices (salmonidés) et la croissance des juvéniles d’espèces marines (sole, bar, turbot). Par contre, la majorité des estuaires présente une contamination bactérienne, provenant des rejets urbains. Cette contamination peut avoir des répercussions pour les activités conchylicoles, la pêche à pied et la baignade.
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